Struktur organisasi SMK Kusuma Bakti disusun untuk menjamin efektivitas penyelenggaraan pendidikan dan pelayanan kepada peserta didik.
- Kepala Sekolah — Drs. Yohanes Baptista Lein
- Wakil Kepala Sekolah Bidang Kurikulum — Fransiska Ose Tokan, S.Pd
- Wakil Kepala Sekolah Bidang Kesiswaan — Antonius Making Tokan, S.Pd
- Wakil Kepala Sekolah Bidang Humas/Hubin — Yakobus Sole Hurint, S.Pd
- Kepala Program Keahlian Broadcasting dan Produksi Film — Yohanes Kopong Making, S.Sn
- Kepala Program Keahlian Asisten Keperawatan — Maria Goreti Kewa, S.Kep., Ns
- Kepala Program Keahlian Teknik Kendaraan Ringan Otomotif — Stefanus Boli Kelen, S.T
